Нервно-мышечные заболевания поражают от 8 до 16 миллионов человек во всем мире, что составляет 0,1-0,2% населения. Низкая распространенность в сочетании с многообразием клинических проявлений существенно затрудняет диагностику. Многие семьи сталкиваются с так называемой "диагностической одиссеей", когда постановка точного диагноза занимает годы. Поскольку 80% редких заболеваний имеют генетическую природу, ключевой задачей исследователей является выявление ответственных за это генов.
Группа ученых из Научно-исследовательского института Sant Joan de Déu (IRSJD) и CNAG разработала инновационный подход к генетическому анализу, позволивший установить диагноз у 23 детей с нервно-мышечными патологиями. В отдельных случаях диагностический поиск продолжался более восьми лет.
В исследовании приняли участие 58 пациентов детской больницы SJD Barcelona. Все они страдали различными формами нервно-мышечных заболеваний, проявляющихся мышечной слабостью или атрофией, и ранее не получили генетического подтверждения диагноза, несмотря на проведение такого метода генетического анализа как секвенирование экзома, который изучает часть ДНК, кодирующую белки, где обычно обнаруживаются мутации, связанные с этими заболеваниями.
Повторный анализ данных пациентов с неустановленным диагнозом, приобретающий все большую актуальность в области редких заболеваний, позволил повысить частоту успешной диагностики с15% до 40%. Этот прогресс стал возможным благодаря постоянному расширению научных знаний и открытию новых генов, ассоциированных с редкими болезнями.
По словам доктора Лесли Маталонги, автора исследования и руководителя по клинической геномике в CNAG:
"Примененная нами методология (полногеномное секвенирование в сочетании с интеграцией омиксных технологий) играет ключевую роль в диагностике сложных случаев. Однако ее внедрение в систему здравоохранения сопряжено с высокими затратами, поэтому в настоящее время подобные исследования преимущественно проводятся в научных проектах. В CNAG мы активно работаем над разработкой инструментов для автоматизации этих процессов, что в перспективе позволит сократить сроки установления диагноза".
Для семей пациентов установление точного диагноза открывает возможности для:
Марти, 10-летний пациент из Террассы, получил диагноз дефицит белка GLDN - ультраредкое заболевание, зарегистрированное всего у четырех человек в мире. Его мать Пилар поделилась:
«В нашем случае нам удалось дать название болезни, но поскольку это крайне редкое заболевание, лечения в настоящее время нет, и нам приходится продолжать полагаться на исследования и поддержку, которую оказывает лечащая команда нашего сына».
За последние 14 лет количество известных генов, ассоциированных с нервно-мышечными заболеваниями, удвоилось, достигнув 700. Тем не менее, более половины пациентов до сих пор не знают происхождения своего заболевания.
Подход, реализованный исследовательскими группами IRSJD и CNAG, специально разработан для помощи этой группе пациентов. Этот инновационный анализ объединяет преимущества различных омиксных методов, позволяя комбинировать большее количество клинических и генетических данных, тем самым увеличивая шансы на выявление новых диагнозов у пациентов.
Разработанный IRSJD и CNAG подход включает:
Доктор Анна Эстеве, руководитель группы функциональной геномики в CNAG, поясняет: "Секвенирование транскриптома позволяет оценить экспрессию генов в мышечной ткани и выявить аномалии сплайсинга, что значительно повышает шансы идентификации патогенных мутаций".
Все генетические данные анализировались с использованием платформы RD-Connect GPAP - инструмента для интеграции и интерпретации геномно-фенотипических данных. Платформа содержит информацию о 30 000 пациентов с редкими заболеваниями и их родственников.
Берта Эстевес, исследователь IRSJD, подчеркивает: "Междисциплинарное сотрудничество было ключевым фактором успеха. Клиническая картина дает нам 'имя' болезни, тогда как генетическое исследование раскрывает ее "фамилию".
Источник статьи: https://www.sjdhospitalbarcelona.org/en/news/innovative-genetic-test-successfully-diagnoses-23-children-neuromuscular-diseases